Το Μουσείο Φυσικής Ιστορίας στεγάζεται στο ανακαινισμένο κτίριο που παλιότερα στέγαζε το κοινοτικό κατάστημα της Πανδρόσου, που είναι ένας απο τους οικισμούς του Δήμου Κομοτηνής. Η ανακαίνιση και ο εξοπλισμός του χρηματοδοτήθηκαν απο το ευρωπαϊκό πρόγραμμα Leader+, ενώ το εποπτικό και εκθεσιακό υλικό του χρηματοδοτήθηκε απο το Δήμο Κομοτηνής. Η λειτουργία του μουσείου, παραχωρήθηκε στην Οικολογική Ομάδα Ροδόπης, με την επιμέλεια της οποίας γίνονται οι ξεναγήσεις.
Το Μουσείο αποτελεί πύλη εισόδου στον οικοσυστημικό πλούτο της Ροδόπης και σκοπός του είναι η ανάδειξη της βιοποικιλότητας της περιοχής της Ροδόπης και των γεωφυσικών και οικολογικών ιδιαιτεροτήτων της, καθώς και η ευαισθητοποίηση των πολιτών σε περιβαλλοντικά θέματα.
Το Μουσείο Φυσικής Ιστορίας έχει ελάχιστα φυσικά εκθέματα. Έχοντας ως αρχή την απαγόρευση της έκθεσης ταριχευμένων ζώων, τη συλλογή του αποτελούν κυρίως πετρώματα και καρποί. Έτσι όλα σχεδόν τα εκθέματα είναι διαδραστικά. Καλούν, δηλαδή, τον επισκέπτη να τα αγγίξει και να παίξει μαζί τους.
Το Μουσείο απευθύνεται κυρίως σε οικογένειες με παιδιά ηλικίας 3-14 ετών.
Ο εκθεσιακός χώρος αποτελείται απο δύο μικρές αίθουσες. Η πρώτη εκθέτει στοιχεία του θαλάσσιου και των υγροτοπικών οικοσυστημάτων του νομού Ροδόπης, ενώ η δεύτερη αίθουσα περιλαμβάνει στοιχεία για τα χερσαία οικοσυστήματα του νομού μας.
Η έκθεση δεν είναι οργανωμένη γραμμικά, αλλά επιτρέπει διαφορετικά σημεία εισόδου του επισκέπτη και ενθαρρύνεται η προσέγγιση του θέματος απο διαφορετικές οπτικές.
Σημειώνεται ότι οι περισσότερες εφαρμογές μέσα στο μουσείο είναι κατάλληλες για άτομα τυφλά ή με χαμηλή όραση, καθώς και για άτομα με κινητικές ή νοητικές αναπηρίες.
Το Μουσείο Φυσικής Ιστορίας έχει ως στόχο: